Основными направлениями научной работы кафедры оториноларингологии МГМСУ им. А.И. Евдокимова является разработка и внедрение новых технологий в диагностике, лечении и профилактике заболеваний лор-органов. Приоритетными направлениями являются:

• Заболевания полости носа и околоносовых пазух, функциональная эндоскопическая хирургия полости носа и околоносовых пазух, балонная синусопластика, навигационная поддержка при операциях.

• Заболевания уха и их лечение, в том числе санирующие операции на среднем ухе, реконструктивные операции на слуховых косточках, различные варианты стапедопластики и тимпанопластики.

• Лечение храпа и синдрома обструктивного апноэ сна, с позиции современного подхода к проблеме (малоинвазивная хирургия мягкого неба).

• Реконструктивная хирургия полости носа и околоносовых пазух (пластика перфораций перегородки носа, болезней оперированного носа).

• Эндоскопическая хирургия болезней глотки.

• Реконструктивная хирургия гортани и трахеи.

• Острые воспалительные заболевания ЛОР-органов.

Результаты исследований отражены в учебниках, монографиях, руководствах для врачей, учебных пособиях, патентах, видеофильмах, диссертациях и научно-практических публикациях в отечественной и зарубежной печати.

Профессора кафедры являются членами редакционных советов Российских журналов, а также членами диссертационных советов по специальности оториноларингология.

На кафедре защищены 42 кандидатских и 4 докторских диссертации.

Сотрудники кафедры активно участвуют в международных и всероссийских научно-практических конференциях, симпозиумах и научно-практических форумах и семинарах.

На кафедре проводятся апробации и клинические исследования лекарственных препаратов.

Ежегодно кафедра проводит междисциплинарные конгрессы: Весна и Осень в Кусково. В рамках этих конгрессов выступают ведущие оториноларингологи РФ, а также специалисты смежных специальностей. Данный подход позволяет междисциплинарно  взглянуть на злободневные проблемы и подобрать единый подход в тяжелых клинических случаях.